目前尚没有一种明确有药的药物能杀灭人乳头瘤病毒（HPV），治疗方法以局部治疗为主，去除外生性疣。

大量的研究表明，现在临床上使用的各种治疗方法的有效率在20%～94%之间。复发率高，通常3个月内最低复发率为25%。病程短于一年，皮损小的治疗成功率相对要高。

1、患者可同时合并其他性病，因此治疗前应检查有无其他的性传播疾病（STDs），尤其是梅毒、淋病和爱滋病等。

2、治疗前，应先治疗局部的其他感染，局部炎症，可使病灶更易扩散。

3、不应采用毒性大的药物或遗留瘢痕的治疗手段和疗法。

4、可在生殖器部位外涂3%～5%的醋酸，以使亚临床感染应得更明显，特别是在阴道镜下应用这种方法有助于发现亚临床感染。

5、男性使用避孕套，以防互相传染。